O Mater Natura é constituído por um grupo de associados com diferentes linhas de atuação, como pesquisa, educação ambiental, políticas públicas, planejamento e manejo de áreas naturais e recuperação do meio ambiente.

Sua estrutura está composta segundo organograma a seguir:

Diretoria do Mater Natura: [março de 2003 a março de 2005]

Paulo Aparecido Pizzi - Presidente Luis Fernando Ribeiro - Vice-Presidente Eliane Aparecida Pizzi - Secretária Deise Carrano Jonson - Tesoureira

Conselho Fiscal: Antonio Carlos Cordeiro da Silva (Coordenador) Paulo Cezar Tosin Luís Fernando Rocha

Coordenação Técnica: Karina Luiza de Oliveira

Coordenação de Projetos: Vide Projetos Executados e em Execução

Conselho Consultivo: Em formação.